| 2007K120620 | Boğaziçi Üniversitesi Öğretim Üyesi Yetiştirme Projesi | | Rektörlük | Diğer | DPT | İleri Araştırma | 2007 | Yürürlükte |
| 09K120520 | Yaşambilimleri Merkezi | | Rektörlük | Fen Bilimleri | DPT | İleri Araştırma | 2009 | Yürürlükte |
| 09C103P | The Political Economy of Sustainable Development in Turkey: An Investigation of Operationalization at the Micro Level | Cem Behar | İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi | Sosyal Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09A501P | Insülin Sinyal Algı ve İleti Yolağının Oluşturulması ve Topolijik Analizi | Kutlu Ülgen | Mühendislik Fakültesi | Mühendislik | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09A502P | Mikro-Kanalda Akan Karışmayan İki Sıvının Arayüzeyinin Elektrik Alanı Ortamında Kararlığının İncelenmesi | Abdullah Kerem Uğuz | Mühendislik Fakültesi | Mühendislik | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09M104 | Kolay İşletilebilirYakıt İşlemcileri için Katalizör tasrımı ve Geliştirilmesi | Ahmet Erhan Aksoylu | Mühendislik Fakültesi | Mühendislik | BAP | Tamamlayıcı Destek | 2009 | Yürürlükte |
| 09C105P | How Does the Increasing Volume of Interbank Funds Affect Bank Efficiency? | Ahmet Faruk Aysan | İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi | Sosyal Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09B507D | Düzenli Hidroksi ve Amin Fonksiyonel Guruplar Bulunduran Polimerlerin ROMP (Ring Opening Metathesis Polymerization) Metoduyla Sentezlenmesi | Ali Ersin Acar | Fen-Edebiyat Fakültesi | Fen Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09A103P | Esnek Yönlendirici ve Yonga-Üstü-Ağ Yapısı Tasarımı | Arda Yurdakul | Mühendislik Fakültesi | Mühendislik | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09M102 | Fotoreseptör Farklılaşmasında Rol Alan Genlerin RNAi Yöntemiyle Susturulması | Arzu Çelik | Fen-Edebiyat Fakültesi | Yaşam Bilimleri | BAP | Tamamlayıcı Destek | 2009 | Yürürlükte |
| 09N201D | Global Supplier Selection Decision: an Integrated Approach | Arzu Tektaş | Uygulamalı Bilimler Yüksekokulu | Sosyal Bilimleri | BAP | Doktora | 2009 | Yürürlükte |
| 09T302P | Kuzey Anadolu Fay Zonu Batı Kesiminde Hız Alanı ve Gerinim Birikiminin GPS ile Belirlenmesi | Aslı Doğru | Kandilli Rasathanesi ve Deprem Araştırma Enstitüsü | Yer Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09B102P | PAGL Geninin ve Cockayne İkinci Geninin Aranması | Aslıhan Tolun | Fen-Edebiyat Fakültesi | Yaşam Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |
| 09A104D | Tüp Bebek Tedavi Sürecinde Yapay Öğrenme Tanbanlı Embriyo Seçimi | Ayşe Bener | Mühendislik Fakültesi | Mühendislik | BAP | Doktora | 2009 | Yürürlükte |
| 09T102P | Atık Lastik Kullanılarak Deprem Zararlarının Azaltılması | Ayşe Edinçliler | Kandilli Rasathanesi ve Deprem Araştırma Enstitüsü | Yer Bilimleri | BAP | Standart | 2009 | Yürürlükte |